Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gp1bbP56400 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gp1bbP56400 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gp1bbP56400 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gp1bbP56400 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gp1bbP56400 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gp1bbP56400 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Gp1bbP56400 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gp1bbP56400 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gp1bbP56400 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gp1bbP56400 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Gp1bbP56400 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gp1bbP56400 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gp1bbP56400 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Gp1bbP56400 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gp1bbP56400 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms