Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dsc1P55849 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dsc1P55849 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dsc1P55849 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dsc1P55849 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dsc1P55849 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dsc1P55849 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Dsc1P55849 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dsc1P55849 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dsc1P55849 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dsc1P55849 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dsc1P55849 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dsc1P55849 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsc1P55849 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dsc1P55849 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dsc1P55849 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsc1P55849 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dsc1P55849 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dsc1P55849 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1739.7 ms