Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CtskP55097 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtskP55097 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtskP55097 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtskP55097 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CtskP55097 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CtskP55097 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtskP55097 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtskP55097 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CtskP55097 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CtskP55097 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CtskP55097 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtskP55097 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtskP55097 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CtskP55097 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtskP55097 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtskP55097 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CtskP55097 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CtskP55097 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CtskP55097 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtskP55097 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CtskP55097 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtskP55097 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CtskP55097 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CtskP55097 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CtskP55097 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CtskP55097 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CtskP55097 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtskP55097 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CtskP55097 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtskP55097 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CtskP55097 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtskP55097 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtskP55097 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CtskP55097 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CtskP55097 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtskP55097 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CtskP55097 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CtskP55097 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CtskP55097 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtskP55097 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CtskP55097 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtskP55097 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtskP55097 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CtskP55097 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CtskP55097 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CtskP55097 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtskP55097 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtskP55097 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtskP55097 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtskP55097 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CtskP55097 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtskP55097 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CtskP55097 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CtskP55097 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CtskP55097 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtskP55097 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtskP55097 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtskP55097 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CtskP55097 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CtskP55097 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtskP55097 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtskP55097 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtskP55097 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CtskP55097 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtskP55097 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtskP55097 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CtskP55097 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CtskP55097 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CtskP55097 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CtskP55097 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtskP55097 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtskP55097 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CtskP55097 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CtskP55097 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtskP55097 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtskP55097 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CtskP55097 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CtskP55097 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtskP55097 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtskP55097 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CtskP55097 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CtskP55097 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtskP55097 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtskP55097 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtskP55097 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtskP55097 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CtskP55097 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtskP55097 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtskP55097 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtskP55097 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtskP55097 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CtskP55097 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CtskP55097 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtskP55097 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtskP55097 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CtskP55097 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CtskP55097 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CtskP55097 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CtskP55097 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms