Protein–RNA interactions for Protein: P52825

Cpt2, Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt2P52825 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cpt2P52825 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpt2P52825 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpt2P52825 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cpt2P52825 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpt2P52825 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpt2P52825 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpt2P52825 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpt2P52825 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cpt2P52825 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cpt2P52825 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms