Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Defa11P50709 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Defa11P50709 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa11P50709 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Defa11P50709 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Defa11P50709 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa11P50709 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa11P50709 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Defa11P50709 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa11P50709 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa11P50709 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Defa11P50709 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Defa11P50709 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms