Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rfx2P48379 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rfx2P48379 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rfx2P48379 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rfx2P48379 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rfx2P48379 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rfx2P48379 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rfx2P48379 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rfx2P48379 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms