Protein–RNA interactions for Protein: P47873

Il11, Interleukin-11, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il11P47873 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Il11P47873 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Il11P47873 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Il11P47873 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Il11P47873 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Il11P47873 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Il11P47873 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Il11P47873 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Il11P47873 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Il11P47873 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Il11P47873 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Il11P47873 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Il11P47873 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Il11P47873 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Il11P47873 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Il11P47873 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Il11P47873 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Il11P47873 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Il11P47873 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il11P47873 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Il11P47873 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il11P47873 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il11P47873 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il11P47873 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il11P47873 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il11P47873 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Il11P47873 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il11P47873 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il11P47873 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il11P47873 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Il11P47873 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Il11P47873 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il11P47873 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il11P47873 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il11P47873 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Il11P47873 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il11P47873 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Il11P47873 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Il11P47873 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il11P47873 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Il11P47873 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il11P47873 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il11P47873 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il11P47873 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il11P47873 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il11P47873 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Il11P47873 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Il11P47873 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il11P47873 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Il11P47873 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Il11P47873 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Il11P47873 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Il11P47873 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Il11P47873 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Il11P47873 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Il11P47873 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il11P47873 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il11P47873 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il11P47873 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Il11P47873 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il11P47873 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il11P47873 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il11P47873 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il11P47873 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Il11P47873 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Il11P47873 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Il11P47873 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Il11P47873 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Il11P47873 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Il11P47873 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il11P47873 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il11P47873 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il11P47873 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il11P47873 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Il11P47873 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il11P47873 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il11P47873 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il11P47873 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Il11P47873 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il11P47873 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il11P47873 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il11P47873 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Il11P47873 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il11P47873 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il11P47873 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il11P47873 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Il11P47873 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Il11P47873 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il11P47873 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Il11P47873 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il11P47873 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Il11P47873 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il11P47873 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il11P47873 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il11P47873 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Il11P47873 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il11P47873 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il11P47873 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il11P47873 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Il11P47873 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms