Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Folr1P35846 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Folr1P35846 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Folr1P35846 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Folr1P35846 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Folr1P35846 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Folr1P35846 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Folr1P35846 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Folr1P35846 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Folr1P35846 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Folr1P35846 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Folr1P35846 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Folr1P35846 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Folr1P35846 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Folr1P35846 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Folr1P35846 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Folr1P35846 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Folr1P35846 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Folr1P35846 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Folr1P35846 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Folr1P35846 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Folr1P35846 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Folr1P35846 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Folr1P35846 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Folr1P35846 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms