Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PvalbP32848 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PvalbP32848 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PvalbP32848 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PvalbP32848 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PvalbP32848 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PvalbP32848 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PvalbP32848 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PvalbP32848 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PvalbP32848 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PvalbP32848 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PvalbP32848 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PvalbP32848 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PvalbP32848 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PvalbP32848 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PvalbP32848 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PvalbP32848 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PvalbP32848 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PvalbP32848 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PvalbP32848 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PvalbP32848 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PvalbP32848 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PvalbP32848 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PvalbP32848 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PvalbP32848 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PvalbP32848 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PvalbP32848 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PvalbP32848 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms