Protein–RNA interactions for Protein: P32442

Meox1, Homeobox protein MOX-1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meox1P32442 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meox1P32442 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meox1P32442 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Meox1P32442 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Meox1P32442 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meox1P32442 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meox1P32442 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Meox1P32442 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Meox1P32442 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meox1P32442 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Meox1P32442 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meox1P32442 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Meox1P32442 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Meox1P32442 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Meox1P32442 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meox1P32442 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meox1P32442 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meox1P32442 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Meox1P32442 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meox1P32442 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Meox1P32442 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Meox1P32442 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms