Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scp2P32020 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Scp2P32020 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Scp2P32020 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scp2P32020 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scp2P32020 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scp2P32020 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scp2P32020 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Scp2P32020 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Scp2P32020 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Scp2P32020 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Scp2P32020 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Scp2P32020 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scp2P32020 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scp2P32020 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Scp2P32020 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Scp2P32020 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Scp2P32020 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Scp2P32020 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Scp2P32020 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scp2P32020 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Scp2P32020 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Scp2P32020 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Scp2P32020 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Scp2P32020 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Scp2P32020 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Scp2P32020 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms