Protein–RNA interactions for Protein: P31955

Areg, Amphiregulin, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AregP31955 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AregP31955 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AregP31955 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AregP31955 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AregP31955 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AregP31955 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AregP31955 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AregP31955 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AregP31955 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AregP31955 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AregP31955 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
AregP31955 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AregP31955 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AregP31955 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AregP31955 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
AregP31955 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AregP31955 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AregP31955 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
AregP31955 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AregP31955 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AregP31955 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AregP31955 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AregP31955 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AregP31955 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AregP31955 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AregP31955 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AregP31955 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AregP31955 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AregP31955 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AregP31955 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AregP31955 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AregP31955 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AregP31955 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AregP31955 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AregP31955 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AregP31955 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AregP31955 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AregP31955 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
AregP31955 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AregP31955 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AregP31955 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AregP31955 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AregP31955 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AregP31955 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AregP31955 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AregP31955 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AregP31955 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AregP31955 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AregP31955 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AregP31955 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AregP31955 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AregP31955 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AregP31955 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AregP31955 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AregP31955 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AregP31955 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AregP31955 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AregP31955 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AregP31955 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AregP31955 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AregP31955 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AregP31955 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AregP31955 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AregP31955 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AregP31955 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AregP31955 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AregP31955 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AregP31955 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AregP31955 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AregP31955 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AregP31955 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AregP31955 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AregP31955 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AregP31955 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AregP31955 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AregP31955 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AregP31955 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AregP31955 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AregP31955 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AregP31955 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AregP31955 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AregP31955 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AregP31955 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AregP31955 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AregP31955 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.33■■□□□ 1
AregP31955 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AregP31955 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AregP31955 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AregP31955 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AregP31955 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AregP31955 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AregP31955 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AregP31955 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AregP31955 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms