Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HexaP29416 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HexaP29416 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HexaP29416 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HexaP29416 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HexaP29416 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HexaP29416 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HexaP29416 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HexaP29416 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexaP29416 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexaP29416 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HexaP29416 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HexaP29416 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HexaP29416 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HexaP29416 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HexaP29416 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HexaP29416 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HexaP29416 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HexaP29416 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HexaP29416 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HexaP29416 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HexaP29416 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HexaP29416 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HexaP29416 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HexaP29416 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HexaP29416 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HexaP29416 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HexaP29416 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HexaP29416 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HexaP29416 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HexaP29416 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HexaP29416 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HexaP29416 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HexaP29416 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HexaP29416 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HexaP29416 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HexaP29416 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HexaP29416 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HexaP29416 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HexaP29416 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HexaP29416 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HexaP29416 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HexaP29416 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HexaP29416 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HexaP29416 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HexaP29416 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HexaP29416 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HexaP29416 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HexaP29416 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HexaP29416 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HexaP29416 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HexaP29416 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HexaP29416 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HexaP29416 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HexaP29416 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HexaP29416 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HexaP29416 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HexaP29416 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HexaP29416 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HexaP29416 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HexaP29416 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HexaP29416 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HexaP29416 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HexaP29416 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HexaP29416 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HexaP29416 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HexaP29416 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HexaP29416 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HexaP29416 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HexaP29416 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms