Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabra3P26049 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabra3P26049 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabra3P26049 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabra3P26049 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabra3P26049 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gabra3P26049 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabra3P26049 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gabra3P26049 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabra3P26049 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabra3P26049 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gabra3P26049 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms