Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RdxP26043 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RdxP26043 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RdxP26043 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RdxP26043 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RdxP26043 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RdxP26043 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RdxP26043 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RdxP26043 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RdxP26043 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RdxP26043 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RdxP26043 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RdxP26043 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RdxP26043 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RdxP26043 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RdxP26043 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RdxP26043 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RdxP26043 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RdxP26043 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RdxP26043 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RdxP26043 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RdxP26043 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RdxP26043 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RdxP26043 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RdxP26043 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RdxP26043 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RdxP26043 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RdxP26043 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RdxP26043 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RdxP26043 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RdxP26043 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RdxP26043 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RdxP26043 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RdxP26043 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RdxP26043 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RdxP26043 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RdxP26043 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RdxP26043 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RdxP26043 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RdxP26043 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RdxP26043 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RdxP26043 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RdxP26043 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RdxP26043 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RdxP26043 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RdxP26043 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RdxP26043 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RdxP26043 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RdxP26043 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RdxP26043 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RdxP26043 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RdxP26043 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RdxP26043 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RdxP26043 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RdxP26043 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RdxP26043 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RdxP26043 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RdxP26043 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RdxP26043 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RdxP26043 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RdxP26043 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RdxP26043 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RdxP26043 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RdxP26043 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RdxP26043 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RdxP26043 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RdxP26043 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RdxP26043 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RdxP26043 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RdxP26043 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RdxP26043 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RdxP26043 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RdxP26043 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RdxP26043 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RdxP26043 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RdxP26043 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RdxP26043 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RdxP26043 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RdxP26043 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RdxP26043 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RdxP26043 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RdxP26043 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RdxP26043 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RdxP26043 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RdxP26043 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RdxP26043 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RdxP26043 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RdxP26043 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RdxP26043 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RdxP26043 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RdxP26043 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RdxP26043 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RdxP26043 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RdxP26043 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RdxP26043 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RdxP26043 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RdxP26043 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RdxP26043 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RdxP26043 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RdxP26043 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms