Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cdk11bP24788 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Cdk11bP24788 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Cdk11bP24788 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Cdk11bP24788 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Cdk11bP24788 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
Cdk11bP24788 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Cdk11bP24788 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
Cdk11bP24788 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
Cdk11bP24788 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Cdk11bP24788 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Cdk11bP24788 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cdk11bP24788 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cdk11bP24788 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cdk11bP24788 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cdk11bP24788 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Cdk11bP24788 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Cdk11bP24788 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Cdk11bP24788 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Cdk11bP24788 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cdk11bP24788 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cdk11bP24788 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Cdk11bP24788 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Cdk11bP24788 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Cdk11bP24788 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cdk11bP24788 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Cdk11bP24788 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cdk11bP24788 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Cdk11bP24788 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Cdk11bP24788 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Cdk11bP24788 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cdk11bP24788 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms