Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PdgfaP20033 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PdgfaP20033 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PdgfaP20033 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PdgfaP20033 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PdgfaP20033 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfaP20033 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfaP20033 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PdgfaP20033 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfaP20033 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PdgfaP20033 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PdgfaP20033 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PdgfaP20033 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfaP20033 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms