Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Phka1P18826 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Phka1P18826 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Phka1P18826 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Phka1P18826 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phka1P18826 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Phka1P18826 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phka1P18826 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phka1P18826 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Phka1P18826 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Phka1P18826 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phka1P18826 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Phka1P18826 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phka1P18826 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Phka1P18826 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Phka1P18826 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phka1P18826 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Phka1P18826 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phka1P18826 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Phka1P18826 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.55■■■□□ 2
Phka1P18826 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Phka1P18826 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Phka1P18826 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Phka1P18826 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phka1P18826 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Phka1P18826 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phka1P18826 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Phka1P18826 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.6 ms