Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Defa-rs1P17533 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Defa-rs1P17533 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Defa-rs1P17533 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Defa-rs1P17533 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Defa-rs1P17533 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs1P17533 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs1P17533 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Defa-rs1P17533 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms