Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CnpP16330 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CnpP16330 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CnpP16330 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CnpP16330 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CnpP16330 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CnpP16330 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CnpP16330 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CnpP16330 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CnpP16330 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CnpP16330 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CnpP16330 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CnpP16330 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CnpP16330 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CnpP16330 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CnpP16330 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CnpP16330 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CnpP16330 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CnpP16330 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CnpP16330 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CnpP16330 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CnpP16330 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CnpP16330 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CnpP16330 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CnpP16330 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CnpP16330 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CnpP16330 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CnpP16330 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CnpP16330 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CnpP16330 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CnpP16330 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CnpP16330 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CnpP16330 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CnpP16330 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CnpP16330 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CnpP16330 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CnpP16330 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CnpP16330 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CnpP16330 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CnpP16330 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CnpP16330 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CnpP16330 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CnpP16330 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CnpP16330 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CnpP16330 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CnpP16330 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CnpP16330 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CnpP16330 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CnpP16330 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CnpP16330 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CnpP16330 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CnpP16330 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CnpP16330 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CnpP16330 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CnpP16330 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
CnpP16330 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CnpP16330 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CnpP16330 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CnpP16330 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CnpP16330 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CnpP16330 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CnpP16330 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CnpP16330 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CnpP16330 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CnpP16330 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CnpP16330 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CnpP16330 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CnpP16330 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CnpP16330 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CnpP16330 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CnpP16330 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CnpP16330 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CnpP16330 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CnpP16330 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CnpP16330 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CnpP16330 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CnpP16330 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CnpP16330 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CnpP16330 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CnpP16330 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CnpP16330 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CnpP16330 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CnpP16330 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CnpP16330 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CnpP16330 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CnpP16330 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CnpP16330 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CnpP16330 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CnpP16330 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CnpP16330 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CnpP16330 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CnpP16330 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CnpP16330 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CnpP16330 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CnpP16330 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CnpP16330 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CnpP16330 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CnpP16330 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CnpP16330 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CnpP16330 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms