Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb2P13373 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vpreb2P13373 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vpreb2P13373 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb2P13373 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vpreb2P13373 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms