Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Schip1P0DPB4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Schip1P0DPB4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Schip1P0DPB4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Schip1P0DPB4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Schip1P0DPB4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Schip1P0DPB4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Schip1P0DPB4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Schip1P0DPB4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Schip1P0DPB4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms