Protein–RNA interactions for Protein: P0DM40

Fer1l5, Fer-1-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 2,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fer1l5P0DM40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fer1l5P0DM40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fer1l5P0DM40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fer1l5P0DM40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fer1l5P0DM40 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fer1l5P0DM40 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fer1l5P0DM40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fer1l5P0DM40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fer1l5P0DM40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fer1l5P0DM40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fer1l5P0DM40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fer1l5P0DM40 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fer1l5P0DM40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fer1l5P0DM40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fer1l5P0DM40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fer1l5P0DM40 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fer1l5P0DM40 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fer1l5P0DM40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fer1l5P0DM40 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fer1l5P0DM40 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms