Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Surf1P09925 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Surf1P09925 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Surf1P09925 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Surf1P09925 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Surf1P09925 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Surf1P09925 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Surf1P09925 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Surf1P09925 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Surf1P09925 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Surf1P09925 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Surf1P09925 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Surf1P09925 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Surf1P09925 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Surf1P09925 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Surf1P09925 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Surf1P09925 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Surf1P09925 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Surf1P09925 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Surf1P09925 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Surf1P09925 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Surf1P09925 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Surf1P09925 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Surf1P09925 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Surf1P09925 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Surf1P09925 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Surf1P09925 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Surf1P09925 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Surf1P09925 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Surf1P09925 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Surf1P09925 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Surf1P09925 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Surf1P09925 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms