Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NclP09405 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NclP09405 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NclP09405 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NclP09405 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
NclP09405 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NclP09405 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NclP09405 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NclP09405 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
NclP09405 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NclP09405 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NclP09405 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NclP09405 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NclP09405 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NclP09405 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NclP09405 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NclP09405 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NclP09405 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NclP09405 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NclP09405 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NclP09405 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NclP09405 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NclP09405 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NclP09405 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NclP09405 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NclP09405 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
NclP09405 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NclP09405 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NclP09405 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NclP09405 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NclP09405 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NclP09405 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NclP09405 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NclP09405 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NclP09405 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NclP09405 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NclP09405 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NclP09405 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NclP09405 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NclP09405 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NclP09405 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NclP09405 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NclP09405 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NclP09405 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NclP09405 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NclP09405 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NclP09405 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NclP09405 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NclP09405 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NclP09405 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NclP09405 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NclP09405 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
NclP09405 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NclP09405 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
NclP09405 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
NclP09405 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
NclP09405 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NclP09405 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
NclP09405 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NclP09405 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NclP09405 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NclP09405 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
NclP09405 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
NclP09405 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NclP09405 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NclP09405 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NclP09405 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NclP09405 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NclP09405 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NclP09405 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NclP09405 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NclP09405 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NclP09405 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
NclP09405 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NclP09405 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NclP09405 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NclP09405 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NclP09405 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
NclP09405 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NclP09405 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NclP09405 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NclP09405 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NclP09405 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NclP09405 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NclP09405 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NclP09405 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NclP09405 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NclP09405 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
NclP09405 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NclP09405 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NclP09405 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
NclP09405 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NclP09405 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
NclP09405 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
NclP09405 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NclP09405 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NclP09405 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NclP09405 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NclP09405 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NclP09405 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms