Protein–RNA interactions for Protein: P02469

Lamb1, Laminin subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb1P02469 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamb1P02469 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamb1P02469 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Lamb1P02469 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Lamb1P02469 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Lamb1P02469 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Lamb1P02469 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Lamb1P02469 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lamb1P02469 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lamb1P02469 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lamb1P02469 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Lamb1P02469 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Lamb1P02469 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Lamb1P02469 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Lamb1P02469 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Lamb1P02469 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Lamb1P02469 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Lamb1P02469 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms