Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Lamc1P02468 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Lamc1P02468 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Lamc1P02468 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Lamc1P02468 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Lamc1P02468 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Lamc1P02468 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lamc1P02468 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lamc1P02468 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lamc1P02468 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lamc1P02468 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Lamc1P02468 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Lamc1P02468 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Lamc1P02468 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Lamc1P02468 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Lamc1P02468 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lamc1P02468 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Lamc1P02468 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Lamc1P02468 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Lamc1P02468 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lamc1P02468 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Lamc1P02468 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Lamc1P02468 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc1P02468 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc1P02468 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Lamc1P02468 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Lamc1P02468 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Lamc1P02468 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Lamc1P02468 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Lamc1P02468 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Lamc1P02468 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Lamc1P02468 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Lamc1P02468 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms