Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
BlmO88700 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
BlmO88700 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
BlmO88700 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BlmO88700 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BlmO88700 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
BlmO88700 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
BlmO88700 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
BlmO88700 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
BlmO88700 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
BlmO88700 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
BlmO88700 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
BlmO88700 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
BlmO88700 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
BlmO88700 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BlmO88700 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
BlmO88700 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BlmO88700 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
BlmO88700 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
BlmO88700 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
BlmO88700 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
BlmO88700 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BlmO88700 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
BlmO88700 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
BlmO88700 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
BlmO88700 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
BlmO88700 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
BlmO88700 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.84
BlmO88700 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
BlmO88700 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
BlmO88700 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
BlmO88700 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
BlmO88700 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
BlmO88700 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
BlmO88700 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
BlmO88700 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
BlmO88700 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BlmO88700 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
BlmO88700 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
BlmO88700 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
BlmO88700 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
BlmO88700 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BlmO88700 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BlmO88700 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
BlmO88700 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
BlmO88700 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
BlmO88700 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
BlmO88700 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
BlmO88700 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
BlmO88700 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
BlmO88700 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.82
BlmO88700 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
BlmO88700 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
BlmO88700 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BlmO88700 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
BlmO88700 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
BlmO88700 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
BlmO88700 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
BlmO88700 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
BlmO88700 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BlmO88700 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
BlmO88700 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BlmO88700 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BlmO88700 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
BlmO88700 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BlmO88700 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
BlmO88700 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
BlmO88700 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
BlmO88700 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
BlmO88700 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
BlmO88700 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
BlmO88700 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
BlmO88700 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
BlmO88700 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
BlmO88700 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
BlmO88700 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
BlmO88700 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
BlmO88700 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
BlmO88700 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
BlmO88700 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
BlmO88700 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
BlmO88700 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
BlmO88700 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
BlmO88700 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
BlmO88700 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
BlmO88700 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
BlmO88700 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
BlmO88700 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
BlmO88700 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
BlmO88700 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
BlmO88700 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
BlmO88700 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
BlmO88700 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
BlmO88700 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
BlmO88700 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
BlmO88700 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
BlmO88700 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
BlmO88700 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
BlmO88700 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
BlmO88700 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms