Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dnmt3bO88509 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnmt3bO88509 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dnmt3bO88509 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Dnmt3bO88509 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dnmt3bO88509 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnmt3bO88509 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnmt3bO88509 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnmt3bO88509 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms