Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaskO70589 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaskO70589 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CaskO70589 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CaskO70589 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaskO70589 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CaskO70589 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CaskO70589 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CaskO70589 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CaskO70589 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaskO70589 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaskO70589 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CaskO70589 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CaskO70589 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaskO70589 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaskO70589 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CaskO70589 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CaskO70589 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaskO70589 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaskO70589 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CaskO70589 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CaskO70589 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CaskO70589 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CaskO70589 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CaskO70589 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CaskO70589 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CaskO70589 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CaskO70589 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CaskO70589 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CaskO70589 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CaskO70589 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CaskO70589 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CaskO70589 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CaskO70589 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CaskO70589 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CaskO70589 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CaskO70589 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CaskO70589 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CaskO70589 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CaskO70589 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CaskO70589 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CaskO70589 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CaskO70589 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CaskO70589 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CaskO70589 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CaskO70589 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CaskO70589 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CaskO70589 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CaskO70589 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CaskO70589 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CaskO70589 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CaskO70589 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CaskO70589 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CaskO70589 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CaskO70589 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CaskO70589 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CaskO70589 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CaskO70589 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CaskO70589 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CaskO70589 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CaskO70589 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CaskO70589 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CaskO70589 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CaskO70589 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CaskO70589 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CaskO70589 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CaskO70589 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CaskO70589 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CaskO70589 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CaskO70589 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CaskO70589 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CaskO70589 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CaskO70589 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CaskO70589 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CaskO70589 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CaskO70589 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CaskO70589 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CaskO70589 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CaskO70589 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CaskO70589 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CaskO70589 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CaskO70589 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CaskO70589 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CaskO70589 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CaskO70589 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CaskO70589 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CaskO70589 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CaskO70589 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CaskO70589 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CaskO70589 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CaskO70589 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CaskO70589 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CaskO70589 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CaskO70589 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CaskO70589 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CaskO70589 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CaskO70589 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CaskO70589 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CaskO70589 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CaskO70589 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms