Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp8O70404 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp8O70404 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp8O70404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp8O70404 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vamp8O70404 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vamp8O70404 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms