Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rad51dO55230 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rad51dO55230 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rad51dO55230 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad51dO55230 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad51dO55230 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rad51dO55230 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rad51dO55230 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rad51dO55230 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms