Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trdmt1O55055 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trdmt1O55055 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trdmt1O55055 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trdmt1O55055 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trdmt1O55055 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Trdmt1O55055 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Trdmt1O55055 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Trdmt1O55055 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trdmt1O55055 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trdmt1O55055 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trdmt1O55055 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trdmt1O55055 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trdmt1O55055 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trdmt1O55055 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Trdmt1O55055 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Trdmt1O55055 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trdmt1O55055 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 274.3 ms