Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BckdkO55028 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BckdkO55028 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BckdkO55028 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdkO55028 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BckdkO55028 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BckdkO55028 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BckdkO55028 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BckdkO55028 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BckdkO55028 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BckdkO55028 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BckdkO55028 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdkO55028 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdkO55028 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BckdkO55028 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BckdkO55028 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BckdkO55028 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BckdkO55028 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BckdkO55028 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BckdkO55028 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BckdkO55028 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BckdkO55028 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BckdkO55028 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BckdkO55028 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BckdkO55028 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BckdkO55028 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms