Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Capn1O35350 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Capn1O35350 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn1O35350 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn1O35350 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn1O35350 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn1O35350 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn1O35350 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn1O35350 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Capn1O35350 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn1O35350 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Capn1O35350 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn1O35350 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn1O35350 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn1O35350 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms