Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ColqO35348 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ColqO35348 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ColqO35348 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ColqO35348 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ColqO35348 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ColqO35348 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ColqO35348 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ColqO35348 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ColqO35348 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ColqO35348 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ColqO35348 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ColqO35348 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ColqO35348 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ColqO35348 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ColqO35348 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ColqO35348 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ColqO35348 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ColqO35348 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ColqO35348 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ColqO35348 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ColqO35348 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ColqO35348 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ColqO35348 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ColqO35348 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ColqO35348 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ColqO35348 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ColqO35348 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ColqO35348 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ColqO35348 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ColqO35348 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ColqO35348 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ColqO35348 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ColqO35348 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ColqO35348 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ColqO35348 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ColqO35348 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ColqO35348 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ColqO35348 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ColqO35348 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ColqO35348 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ColqO35348 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ColqO35348 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ColqO35348 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ColqO35348 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ColqO35348 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ColqO35348 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ColqO35348 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ColqO35348 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ColqO35348 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ColqO35348 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ColqO35348 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ColqO35348 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ColqO35348 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ColqO35348 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ColqO35348 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ColqO35348 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ColqO35348 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ColqO35348 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ColqO35348 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ColqO35348 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ColqO35348 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ColqO35348 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ColqO35348 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ColqO35348 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ColqO35348 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ColqO35348 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ColqO35348 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ColqO35348 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ColqO35348 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ColqO35348 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ColqO35348 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ColqO35348 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ColqO35348 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ColqO35348 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ColqO35348 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ColqO35348 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ColqO35348 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ColqO35348 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ColqO35348 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ColqO35348 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ColqO35348 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ColqO35348 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ColqO35348 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ColqO35348 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ColqO35348 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ColqO35348 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ColqO35348 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms