Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bhlhe40O35185 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bhlhe40O35185 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Bhlhe40O35185 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bhlhe40O35185 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Bhlhe40O35185 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Bhlhe40O35185 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bhlhe40O35185 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bhlhe40O35185 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bhlhe40O35185 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Bhlhe40O35185 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms