Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nedd9O35177 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nedd9O35177 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nedd9O35177 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nedd9O35177 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Nedd9O35177 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nedd9O35177 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nedd9O35177 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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