Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Kif3cO35066 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kif3cO35066 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kif3cO35066 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Kif3cO35066 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kif3cO35066 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Kif3cO35066 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kif3cO35066 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kif3cO35066 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms