Protein–RNA interactions for Protein: O09061

Psmb1, Proteasome subunit beta type-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb1O09061 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmb1O09061 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmb1O09061 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmb1O09061 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmb1O09061 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmb1O09061 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmb1O09061 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psmb1O09061 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms