Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Flot1O08917 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Flot1O08917 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Flot1O08917 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Flot1O08917 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Flot1O08917 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Flot1O08917 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Flot1O08917 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Flot1O08917 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Flot1O08917 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Flot1O08917 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Flot1O08917 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Flot1O08917 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Flot1O08917 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Flot1O08917 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Flot1O08917 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flot1O08917 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Flot1O08917 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Flot1O08917 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flot1O08917 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flot1O08917 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Flot1O08917 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Flot1O08917 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Flot1O08917 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Flot1O08917 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flot1O08917 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Flot1O08917 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Flot1O08917 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Flot1O08917 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Flot1O08917 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Flot1O08917 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Flot1O08917 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Flot1O08917 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Flot1O08917 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms