Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MttpO08601 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MttpO08601 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MttpO08601 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MttpO08601 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MttpO08601 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MttpO08601 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MttpO08601 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MttpO08601 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MttpO08601 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MttpO08601 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MttpO08601 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MttpO08601 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MttpO08601 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MttpO08601 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MttpO08601 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MttpO08601 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MttpO08601 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MttpO08601 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MttpO08601 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MttpO08601 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MttpO08601 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MttpO08601 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MttpO08601 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MttpO08601 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MttpO08601 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MttpO08601 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MttpO08601 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MttpO08601 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MttpO08601 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MttpO08601 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MttpO08601 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MttpO08601 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MttpO08601 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MttpO08601 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MttpO08601 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MttpO08601 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MttpO08601 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MttpO08601 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MttpO08601 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MttpO08601 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MttpO08601 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MttpO08601 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MttpO08601 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MttpO08601 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MttpO08601 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MttpO08601 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MttpO08601 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MttpO08601 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MttpO08601 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MttpO08601 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MttpO08601 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MttpO08601 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MttpO08601 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MttpO08601 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MttpO08601 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MttpO08601 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MttpO08601 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MttpO08601 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MttpO08601 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MttpO08601 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MttpO08601 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MttpO08601 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MttpO08601 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MttpO08601 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MttpO08601 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MttpO08601 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MttpO08601 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MttpO08601 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MttpO08601 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MttpO08601 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MttpO08601 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MttpO08601 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MttpO08601 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MttpO08601 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MttpO08601 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MttpO08601 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MttpO08601 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MttpO08601 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MttpO08601 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MttpO08601 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MttpO08601 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MttpO08601 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MttpO08601 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MttpO08601 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MttpO08601 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MttpO08601 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MttpO08601 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MttpO08601 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MttpO08601 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MttpO08601 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MttpO08601 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MttpO08601 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MttpO08601 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MttpO08601 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MttpO08601 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MttpO08601 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MttpO08601 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MttpO08601 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MttpO08601 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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