Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Efna3O08545 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna3O08545 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna3O08545 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna3O08545 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna3O08545 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna3O08545 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna3O08545 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna3O08545 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna3O08545 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna3O08545 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna3O08545 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna3O08545 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Efna3O08545 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna3O08545 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Efna3O08545 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna3O08545 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Efna3O08545 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna3O08545 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Efna3O08545 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms