Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3542K7N6U2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3542K7N6U2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3542K7N6U2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3542K7N6U2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3542K7N6U2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm3542K7N6U2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3542K7N6U2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3542K7N6U2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3542K7N6U2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gm3542K7N6U2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm3542K7N6U2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3542K7N6U2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3542K7N6U2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3542K7N6U2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3542K7N6U2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3542K7N6U2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3542K7N6U2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3542K7N6U2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm3542K7N6U2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
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