Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmem200cJ3QK46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmem200cJ3QK46 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmem200cJ3QK46 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tmem200cJ3QK46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmem200cJ3QK46 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmem200cJ3QK46 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tmem200cJ3QK46 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmem200cJ3QK46 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms