Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SprtnG3X912 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SprtnG3X912 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SprtnG3X912 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SprtnG3X912 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SprtnG3X912 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SprtnG3X912 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SprtnG3X912 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SprtnG3X912 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SprtnG3X912 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SprtnG3X912 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SprtnG3X912 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SprtnG3X912 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SprtnG3X912 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SprtnG3X912 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.3 ms