Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim15G3UY57 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim15G3UY57 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim15G3UY57 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim15G3UY57 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim15G3UY57 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim15G3UY57 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim15G3UY57 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms