Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lmod3E9QA62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lmod3E9QA62 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Lmod3E9QA62 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Lmod3E9QA62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmod3E9QA62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Lmod3E9QA62 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Lmod3E9QA62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Lmod3E9QA62 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Lmod3E9QA62 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms