Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8I6

Vmn1r55, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r55E9Q8I6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vmn1r55E9Q8I6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Vmn1r55E9Q8I6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r55E9Q8I6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vmn1r55E9Q8I6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vmn1r55E9Q8I6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Vmn1r55E9Q8I6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Vmn1r55E9Q8I6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Vmn1r55E9Q8I6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Vmn1r55E9Q8I6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vmn1r55E9Q8I6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vmn1r55E9Q8I6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vmn1r55E9Q8I6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Vmn1r55E9Q8I6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Vmn1r55E9Q8I6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vmn1r55E9Q8I6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Vmn1r55E9Q8I6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms