Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Itga10E9Q6R1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Itga10E9Q6R1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Itga10E9Q6R1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Itga10E9Q6R1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Itga10E9Q6R1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Itga10E9Q6R1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Itga10E9Q6R1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Itga10E9Q6R1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms